Ministerstwa Funduszy i Polityki Regionalnej – Departamentu Koordynacji Wdrażania Funduszy Unii Europejskiej, w piśmie z dnia 29.02.2024 r. znak DKF-IV.6817.9.2024.DS, dotyczącym kwalifikowalności podatku VAT w projektach UE (2021-2027), stwierdził, że jest możliwe odzyskanie podatku VAT od projektów o wartości poniżej 5 mln euro nawet jeśli podatek VAT został uznany za kwalifikowalny – brak podwójnego finansowania
Zasady kwalifikowalności VAT w projektach poniżej 5 mln EUR
Jak wynika z pkt 1 podrozdziału 3.5 Wytycznych, w myśl art. 64 ust. 1 lit. c tiret i rozporządzenia ogólnego, podatek VAT w projekcie (nieobjętym pomocą publiczną), którego łączny koszt jest mniejszy niż 5 mln EUR (z VAT), może być kwalifikowalny – niezależnie od tego, czy „podlega zwrotowi na mocy krajowych przepisów dotyczących VAT”, czy też nie.
W projektach o wartości poniżej 5 mln EUR instytucje nie są zobowiązane badać możliwości odzyskania podatku VAT zgodnie z przepisami prawa podatkowego. Za dopuszczalną na gruncie przepisów funduszowych można uznać sytuację, w której podmiot otrzymujący dofinansowanie zapłaconego podatku VAT w projekcie o łącznym koszcie niższym niż 5 mln EUR (z VAT) odzyskuje VAT na gruncie przepisów podatkowych. Przypadek ten nie zostanie uznany za podwójne finansowanie.
Potwierdzenie przez Komisję Europejską
Powyższe zostało potwierdzone przez Komisję Europejską (KE) w odpowiedziach oznaczonych w RegioWiki Extranet jako
-
QA00002 – ELIGIBILITY OF VAT UNDER COHESION POLICY RULES IN THE 2021-2027 PROGRAMMING PERIOD
-
QA00063 – DOUBLE FINANCING OF VAT
-
QA00176 – VAT ELIGIBILITY AND PROJECT TOTAL COSTS
-
QA00262 – VAT ELIGIBILITY
Definicja łącznego kosztu projektu
Łączny koszt projektu należy rozumieć jako całkowity koszt projektu obejmujący koszty kwalifikowalne i niekwalifikowalne. Do przeliczenia łącznego kosztu projektu stosuje się miesięczny obrachunkowy kurs wymiany walut stosowany przez KE, aktualny w dniu zawarcia umowy o dofinansowanie projektu.
Praktyczne zastosowanie w projektach
Mając na uwadze powyżej zacytowane stanowisko Ministerstwa Funduszy i Polityki Regionalnej, biorąc pod uwagę, że realizowany będzie projekt, którego koszt jest niższy niż 5 mln EUR (z VAT), można dopuścić sytuację, w której VAT zostanie uznany za kwalifikowalny dla całego projektu, niezależnie od tego, że część działań realizowana będzie na szlakach, na których pobierane są opłaty.
Dodatkowe uwagi dotyczące VAT
Należy pamiętać, że kwalifikowalność podatku VAT podlega dodatkowym ograniczeniom wynikającym z zasad udzielania pomocy publicznej. Ponadto, ponowne badanie kwalifikowalności podatku VAT jest wymagane w przypadku zmiany łącznego kosztu projektu mającej wpływ na kwalifikowalność VAT.
W przypadku projektów o wartości co najmniej 5 mln EUR (włączając VAT), podatek VAT może być kwalifikowalny jedynie gdy brak jest prawnej możliwości odzyskania podatku VAT zgodnie z przepisami prawa krajowego. Oznacza to, że posiadanie prawa do odliczenia VAT (nawet jeśli faktycznie zwrot nie nastąpił) wyklucza uznanie wydatku za kwalifikowalny
